هر چند اجرای ترور‌ دانشمندان هسته ای توسط سازمان‌های امنیتی غربی صورت گرفته اما به گفته برخی مسؤولان عوامل پشت پرده آن برخی عناصر خودفروخته داخلی هستند. حجت‌الاسلام والمسلمین سیدابراهیم رئیسی پس از ترور مجید شهریاری در سخنانی در جمع نمازگزاران تهرانی به عوامل پشت پرده این ترور دانشمندان اشاره کرد و گفت: بدانید این موضوع عوامل پشت پرده‌اش همان جریان صهیونیست و سازمان جاسوسی موساد است که با کمک یکسری عوامل خودفروخته داخلی دست به این کارها می‌زنند. معاون اول قوه قضائیه نقش این عوامل نفاق داخلی را فروش اطلاعات و شناسایی استادان هسته‌ای کشورمان به عوامل تروریستی عنوان کرد و گفت: منافقان مجبور شدند بعد از برخورد قاطع نظام با آنان به جمع جاسوسان برای اسرائیل و آمریکا بپیوندند و بدون شک در ترور شهید شهریاری گزارشاتی از سوی آنان مخابره شده است.

- سال 84 یک گروه مخفی تحت پوشش سازمان جاسوسی آمریکا برای شناسایی دانشمندان هسته‌ای کشورمان فعال شد. در نتیجه فعالیت این گروه بود که چند سال بعد برخی دانشمندان هسته‌ای کشورمان مانند دکتر فریدون عباسی از سوی ایالات متحده در لیست تحریم شورای امنیت قرار گرفتند. اما نکته جالب توجه آنکه همزمان با فعال شدن CIA برای جمع‌آوری اطلاعات دانشمندان هسته‌ای ایران در سال 84، احمد شیرزاد نماینده اصلاح‌طلب مجلس ششم رسما خواستار اطلاع از اسامی دانشمندان هسته‌ای کشورمان می‌شود. این در حالی بود که وی در برابر سوال بزرگی قرار می‌گرفت که چرا باید او از اسامی دانشمندان هسته‌ای کشورمان اطلاع یابد؟ همان سال برخی فعالان سیاسی از آشکار شدن همکاری‌های شیرزاد و بیگانگان خبرداده و خواستار شکایت از وی می‌شوند. یکی ازاین افراد محمدحسن قدیری ابیانه است. او شیرزاد را متهم به همکاری با دشمنان نظام کرده و براین عقیده است که افرادی مانند شیرزاد نشان داده‌اند که هر زمانی که غرب برای توطئه‌های خود علیه ملت ایران به آنها نیاز دارد، در انجام وظیفه حاضرند.

صحبت های شیرزاد پس از ترور شهید علیمحمدی هم جالب توجه است. همان زمان که مسئولان کشورمان اعلام کردند دکتر علیمحمدی از دانشمندان مرتبط با فعالیت های هسته ای جمهوری اسلامی بوده و موساد برای تحت فشار گذاشتن ایران در زمینه هسته ای به ترور این دانشمند هسته ای زده است... شیرزاد همان زمان برای اینکه افکار عمومی را از سوی سازمان های تروریستی غربی منحرف کند در مطلبی که در وبگاه خود منتشر کرد و البته مورد استناد شبکه های اپوزیسون قرار گرفت مدعی شد دانش دکتر علمیحمدی به هیچ وجه مرتبط با علم هسته ای نیست . (بخشی از گزارشی که برای دستگیری عوامل ترور دکتر علیمحمدی در روزنامه وطن امروز نوشتم.21/10/89 - با اندکی دخل و تصرف)